El modelado fluvial principal viene marcado por las cuencas del Guadalaviar (posteriormente Turia), Jiloca, Tajo, Júcar y Cabriel, ya que la Sierra de Albarracín alberga en su seno el nacimiento de algunos importantes ríos peninsulares.

Estos ríos a lo largo de su recorrido han excavado profundos cañones de varios cientos de metros, abiertos fundamentalmente en materiales calizos. Algunos ejemplos de estos cañones los podemos encontrar en el rio Guadalaviar en el tramo entre Villar del Cobo y Tramacastilla, zona conocida como Barrancondo.

Además de las diversas fuentes, riachuelos y arroyos que la climatología y la hidrologíavan dejando en la zona, es conveniente también recordar las acumulaciones de tobas calcáreas en algunas zonas de los valles, siendo significativas las de Calomarde en Tramasaguas y las del Río Cabriel en el Vallecillo.